Emanuel Fernandes começou a jogar futebol no Sporting CP, em 2011, no Pólo EUL. Passou três anos no SG Sacavenense e regressou ao Pólo Universitário, de onde transitou para os escalões da Academia Sporting. Campeão nacional de iniciados de Leão ao peito, sonha com aquilo que todos sonham quando entram no Clube: chegar à equipa principal e ser campeão.
Com contrato profissional com os Leões desde abril de 2021, integrou o plantel sub-23 e transita este ano para a equipa B, subindo mais um patamar competitivo.