Mateus Fernandes é natural de Olhão e começou a jogar futebol no SC Olhanense, aos cinco anos. O seu talento não escapou ao Sporting CP, e em 2016 passou a actuar de Leão ao peito. Residente na Academia Sporting desde 2017, foi campeão nacional de iniciados em 2019, prova na qual foi determinante e na qual apontou quatro golos na fase de apuramento do campeão.

Com contrato profissional desde outubro de 2020, foi recentemente chamado aos trabalhos de preparação da selecção nacional portuguesa de sub-17. No Sporting integrará este ano o plantel sub-23, no qual já se estreou no passado mês de abril.