Rafael Besugo joga no Sporting CP desde os 8 anos de idade e não conhece outro clube em todo o seu percurso futebolístico. Campeão nacional de sub-15, em 2019, ganhou o seu espaço no plantel sub-23, onde ao longo das temporadas 2021 a 2024, fez mais de 60 jogos.

Está desde a temporada 2024/25 na equipa B, tendo feito op percurso da Liga 3 para a Liga Portugal 2, onde o Sporting CP B volta a competir nesta temporada.