Francisco Canário é natural de Portalegre e, tal como o pai, ex-jogador de futebol e hoje treinador, começou a jogar no Sport Clube Estrela, da sua cidade natal. Assinou pelo Sporting CP a 29 de setembro de 2012, para actuar na equipa de benjamins dos Leões, enquento treinava durante a semana no clube onde iniciou a formação. Campeão distrital e nacional de iniciados ao serviço do Sporting, rumou em 2020 ao Vitória SC.

O regresso aos Leões aconteceu em junho de 2022, graças a uma temporada de grande nível ao serviço dos juniores vitorianos, onde marcou 16 golos em 21 encontros disputados. Feliz pelo regresso, Canário afirma que chega mais maduro ao Clube do seu coração e mostra-se satisfeito com a sua evolução, que agora espera materializar, aproveitando a oportunidade de voltar a casa.