Rafael Silva é natural e Sete Lagoas, estado de Minas Gerais, no Brasil. Jogou nos escalões de formação do Ponte Preta e foi de lá que em 2022 chegou para os sub-19 do Real Valladolid CF. Meia temporada volvida deu-se o regresso ao Brasil, desta vez para jogar nos sub-20 do Cruzeiro, onde venceu o campeonato Mineiro deste escalão.

Chegou ao Sporting CP após meia temporada ao serviço do Leixões SC, onde se revelou uma peça importante na defesa da equipa de Matosinhos. Campeão na época de estreia de Leão ao peito, passou a última temporada emprestado no Chipre e na Letónia. Regressa agora ao Clube, para o retorno da equipa B à Liga 2.